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星球概况:

▲生物医学科研人员的小密圈,注重科研互助,干货分享,同时建立优质人脉。

▲嘉宾信息

●吴思涵:得州大学西南医学中心助理教授,肿瘤ecDNA方向。

●东华君:神经生物学博士,美国NIH博士后,通过非人灵长类动物模型和行为电生理手段,研究高级认知功能的神经机制。

●骏恒:郑博士,中山大学生命科学学院博士后,从事肿瘤学与成体干细胞领域研究,目前专注于肿瘤模型的构建以及肿瘤转移机制的研究。

●韩博炜:中山大学肿瘤防治中心特聘副研究员,从事肿瘤学、分子生物学、生物信息学领域研究。

●三月之月:杨博士,美国德克萨斯A&M大学数量遗传学博士,曾任Arizona州立大学生物信息中心主任,现任世和基因副总监,主攻癌症早筛方向。

●鲮鱼不会飞:孟博士,毕业于北京大学生命科学学院,专注RNA表观遗传学领域研究,擅长基因芯片,二、三代测序,以及3D基因组学数据分析。

●Vigorous:病原生物学博士(医学病毒方向),高校科研教学人员,主要从事RNA病毒的复制机理研究和新型疫苗的研发工作。

精选主题预览:

#干货分享 如何在R中进行药理效应曲线拟合——以时效曲线为例

量效曲线和时效曲线的绘制,是药理研究中最常用的方法。一般而言,我们可以使用4参数或者5参数的logistic或者log-logistic回归来做。这里推荐一个计算速度非常快的R包,专门为药理学研究设计:drda

首先模拟一组数据(图1),是不同处理时间,对某测量值产生的相对效应,以0小时100%作为基准。

图2即非常简单的代码:首先是用drda()函数拟合模型,这里选的是4参数的log-logistic函数。…


#干货分享 什么是向量化编程(Vectorization)——以R语言为例

R是生信研究中常用的工具,但我看很多R教程并没有提及向量化编程或者计算这个概念。实际上,即使在不清楚这个概念的情况下,我们在许多具体应用上,已经在使用向量化计算了。

举个例子,我们想把一个dataframe的列a与列b相减,得到一个列c,我们会很自然地这么做:

df$c = df$a – df$b

这其实就是向量化计算。在这个计算过程中,a和b两个数列的每一个值,都有一个具体的坐标。而获得c的过…


关于统计检验和线性模型可以看看这篇文章:

https:u002Fu002Flindeloev.github.iou002Ftests-as-linearu002F…


老师您好。我们团队是做乙肝病毒的。乙肝病毒的基因组是长度为3.2kb的共价闭合环状DNA(cccDNA)。2021年我们团队通过邻近连接测序4C-seq技术发现乙肝病毒的基因组倾向于分布在HepG2细胞19号染色体附近。这个表型的选择性很强。由于乙肝病毒基因组与ecDNA…


#干货分享 我们实验室招收博士后一名,从事肿瘤ecDNA生物学研究。详情请点击以下链接:

Postdoc …


#干货分享 推荐一篇写得很好的DESeq2教程

DESeq2 experimental design and interpretation

DESeq2 experimental design and i…

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